Pomembna je čistost olja, saj so ribe in njihovo olje obremenjene s težkimi kovinami in drugimi polutanti (PCB, dioksin itd), ki se v telesu kopičijo in so zelo škodljivi. Da jih izločimo iz olja, je potreben postopek molekularne destilacije EPA in DHA. Z njo tudi dosežejo, da produkt nima okusa po ribah in da je delež omega-3 v olju precej višji (okrog 70%) kot v izvornem ribjem olju. Certifikat odličnosti IFOS – International Fish Oil Standard (ocena 5 na lestvici od 0 do 5), ki ga podeljuje neodvisna organizacija pri kanadski univerzi v Guelphu, dokazuje to kakovost. Ribja olja, ki imajo certifikat odličnosti IFOS so dražja, saj je postopek molekularne destilacije zelo drag, toda v primerjavi z nedestiliranim oljem vsebujejo več kot dvakratno količino EPA in DHA.
Pomembni so certifikati kakovosti omega-3
